Collecter, lire, interpréter et annoter une grande masse de données textuelles n'est pas chose facile depuis le développement des nouvelles technologies dont Internet qui propose pléthore d'informations. Ces tâches sont d'autant plus fastidieuses à mener dans le domaine de la biologie où les intervenants doivent constamment être informés des nouveautés mais aussi réaliser des expériences sur la paillasse pour publier à leur tour leurs travaux et rester concurrentiels. Cet article propose de construire une ontologie, de la peupler automatiquement grâce à une méthode de traitement automatique des langues : les patrons lexico-syntaxiques. Une évaluation de l'extraction de connaissances est réalisée et présente une précision de 72% ainsi qu'un rappel de 50%.